À l’ancre près de l’île, la tension monte encore parmi l’équipage. Profitant d’un moment d’agitation générale, Jim se glisse discrètement dans l’un des canots qui partent pour la première reconnaissance à terre, sans être remarqué par ses compagnons ni par les mutins.
Une fois sur l’île, Jim s’écarte du groupe et assiste, caché, à une scène terrible : Long John Silver tue de sang-froid Tom, un marin resté loyal qui refusait de rejoindre la mutinerie. Bouleversé et terrifié à l’idée d’être découvert, Jim s’enfuit seul à travers la forêt de l’île.
Poursuivant sa fuite, Jim aperçoit une silhouette étrange, mi-homme mi-bête, qui le prend d’abord pour un fantôme : il s’agit en réalité de Ben Gunn, un ancien marin abandonné seul sur l’île des années auparavant par le capitaine Flint lui-même.
Ben Gunn, devenu un peu sauvage à force de solitude mais toujours vif d’esprit, raconte son histoire à Jim et lui laisse entendre qu’il pourrait se montrer très utile dans la lutte à venir contre Long John Silver et ses hommes, en échange d’une part du trésor et d’un passage de retour vers l’Angleterre.
